Как заявляют разработчики, в скором времени своеобразный бактериальный «термометр» можно будет использовать для более быстрой диагностики и своевременного начала лечения инфекций.
Команда инженеров из США разработала веб-инструмент под названием Taxonomer, которая может анализировать данные метагенома, как ДНК и РНК, со скоростью от 10 до 100 раз быстрее, чем имеющихся в настоящее время программное обеспечение.
По заявлениям разработчиков, Taxonomer способен обнаружить любой известный вирус, бактерия или грибок, а также выявлять новые, неизвестные ранее патогенные микроорганизмы. Представляя результаты своих исследований в издании Genome Biology, авторы программы отмечают, что их инструмент смог обнаружить неизвестные патогены у пациентов, которые ранее не выявлялись в лабораторных испытаниях. Также Taxonomer вполне способен правильно определить микробного загрязнения в стволовых клеточных культурах.
Авторы программы обещают, что это будет полностью бесплатный инструмент, который можно использовать как на персональных компьютерах, так и на мобильных устройствах, что позволит проводить быстрый обмен данными в ответ на вспышки инфекционных заболеваний. Все, что требуется – загрузить часть генетической последовательности в файле специального формата на их сайт и подождать несколько минут.
