По мере развития болезни появляются новые клинические симптомы, характерные для каждой ГЛ. Так, при КГЛ нередки боль в эпигастрии, рвота, что в начале болезни ошибочно принимают за пищевую токсикоинфекцию, но при этом выражена брадикардия (пульс до 40-50 уд/мин). Несмотря на наличие ГСм, отсутствуют эритроциты в моче или их очень мало, за что КГЛ получила название «ГЛ без почечного синдрома». У многих больных возникают носовые, легочные, желудочно-кишечные, маточные кровотечения. В периферической крови на фоне анемии рано появляются лейкопения со сдвигом влево до юных и миелоцитов, тромбоцитопения, РОЭ чаще замедлена. КГЛ обычно возникает в весенне-летний сезон. При ГЛСПС быстро нарастает интоксикация, появляются жажда, рвота, боль в пояснице, даже прикосновение к ней вызывает боль.
Развивается олигурия вплоть до анурии с последующей полиурией (на 2-й неделе болезни). В отличие от КГЛ, выражена тахикардия, в крови лейкопения, сменяющаяся лейкоцитозом, тромбоцитопения, РОЭ ускорена; повышены активность трансфераз, уровень мочевины и креатинина. В моче — эритроциты, большое количество белка, восковидные цилиндры. ГЛСПС регистрируется в течение всего года. При омской геморрагической лихорадке начало заболевания внезапное, появляются сильная головная боль, боль в конечностях и спине. ГСм выражен слабее, чем при КГЛ. Иногда увеличены лимфоузлы шеи и подмышечных впадин. Наблюдаемые в последние годы заболевания геморрагическими лихорадками у туристов, прибывших из различных зарубежных стран, должны настораживать в отношении своевременной диагностики и более широкого лабораторного обследования больных с целью исключения наиболее контагиозных из них (Ласса, Марбург, Эбола).