Хронический сап может протекать в течение нескольких лет в кожной, легочной и носовой формах, причем происходит смена фаз улучшения и ухудшения состояния больного. Наиболее часто встречается кожная форма. Характерно медленное развитие пустул и язв с регионарным лимфангоитом. Глубокие язвы медленно гранулируют, имеют маслянисто-желтое отделяемое с примесью крови. Язвы заживают медленно, часто рецидивируют и оставляют обширные твердые рубцы. Формируется множество мышечных абсцессов, чаще в икроножных мышцах, которые самопроизвольно вскрываются с образованием длительно не заживающих рецидивирующих свищей.
С гноем из свищей выделяются возбудители сапа. Легочная форма проявляется признаками «ползучей» плевропневмонии с преимущественным поражением нижней доли легких. Позже при этой форме присоединяются множественные мышечные абсцессы. При поражении слизистой оболочки носа характерны серозно-гнойные выделения, желто-зеленые корки и глубокие изъязвления, распространяющиеся до глотки, гортани, трахеи. В области основания носа появляется распространяющаяся на обе стороны припухлость кожи с яркой гиперемией, определяющие характерный внешний вид больного. При хроническом сапе имеется выраженная интоксикация, длительная лихорадка неправильного типа, больные постепенно слабеют, развивается кахексия. Нередко присоединяется вторичная инфекция. Прогноз при сапе всегда серьезный. При острой форме без лечения летальность составляет 100%, при хронической — около 50%.