В этой стадии болезни отчетливо преобладают очаговые поражения различных органов и систем, которые протекают на фоне слабо выраженной общей интоксикации и небольшого повышения температуры. Они носят рецидивирующий характер, периоды ремиссии между обострениями длятся 1-2 и более мес. Поражения опорно-двигательного аппарата проявляются длительно текущими моно- и полиартритами с вовлечением околосуставной клетчатки (периартриты), им сопутствуют бурситы, тендовагиниты, перихондриты, периоститы. Чаще обнаруживают фиброзиты и целлюлиты в пояснично-крестцовой области и над локтевыми суставами. В позвоночнике ограничены движения, выявляются деформации и деструктивные изменения, которые сопровождаются сильной болью Возможны и другие жалобы; вегетососудистая дистония, быстрая нервная истощаемость, бессоница, раздражительность.
Снижается социальная адаптация, развиваются неврозы. Отчетливей проявляются воспалительные изменения со стороны урогенитальной системы. У мужчин — орхиты и эпидидимиты, импотенция, у женщин -эндометриты, сальпингоофориты, дисменореи, бесплодие или выкидыши. Возможен нейро- и психобруцеллез, сопровождающийся астеническим синдромом и потерей массы тела. Хроническая форма бруцеллеза длится 2-3 года. При уменьшении жалоб и выраженности локальных поражений, с исчезновением возбудителя в крови наступает резидуальная стадия бруцеллеза — клиника его последствий. В этот период клинические проявления хронического бруцеллеза не выражены; преобладают функциональные нарушения. Сероаллергические реакции на бруцеллез становятся отрицательными.